Sindrom Pubertas adalah fenomena misterius yang disebabkan oleh kondisi mental seseorang yang tidak stabil.
Sakuta Azusagawa yang bertemu dengan gadis-gadis pengidap sindrom pubertas saat SMA, kini telah lulus dan menjadi mahasiswa. Dia kuliah di sebuah universitas di Kanazawa Hakkei bersama kekasihnya, Mai Sakurajima, artis yang sangat populer.
Suatu hari, Sakuta melihat Miniskirt Santa padahal tidak sedang natal.
“Aku terkejut, kamu bisa melihatku ya” ucap Miniskirt Santa.
Sebuah kalimat yang sepertinya pernah Sakuta dengar sebelumnya.
Gadis itu mengatakan pada Sakuta kalau ia sedang membagikan sindrom pubertas.
